Les systèmes de traitement secondaire avancé sont utilisés lorsque les conditions de terrain ne sont pas favorables à la mise en place d'un système de traitement primaire et secondaire. Ainsi, un sol argileux, le roc près de la surface, une nappe phréatique peu profonde, une superficie de terrain restreinte ou l'impossibilité de respecter la distance requise par rapport à un puits, sont toutes des conditions qui nécessitent un traitement secondaire avancé. L'effluent sera ensuite rejeté dans un champ de polissage (environ 50% plus petit qu'un champ d'épuration conventionnel) ou dirigé vers un système de traitement tertiaire, pour ensuite être rejeté en surface dans l'environnement. Toutes ces technologies sont constituées d'un ensemble d'équipements de procédé nécessitant un contrat d'entretien annuel avec leur fabricant. Elles utilisent toutes une fosse septique, à l'exception du système Hydro-Kinetic.